Vijeće korisnika čine CARNet koordinatori ustanova članica CARNeta kao predstavnici akademske zajednice,  voditelji županijskih vijeća  informatike kao predstavnici korisnika iz sustava školstva te ravnatelj CARNeta. Radom Vijeća korisnika koordinira predsjedništvo koje sačinjavaju predsjednik i šest članova, od kojih su najmanje dva člana iz akademske zajednice, odnosno najmanje dva člana iz sustava školstva. Predsjedništvo Vijeća korisnika biraju korisnici među sobom. Vijeće korisnika sastaje se po potrebi, najmanje jednom u dvije godine a saziva ga predsjednik. Ravnatelj CARNeta može sazvati sjednicu Vijeća korisnika temeljem pismenog zahtjeva najmanje deset koordinatora korisnika.

Vijeće korisnika ima savjetodavnu ulogu spram ravnatelja. Vijeće korisnika predlaže mjere za poboljšanje infrastrukture i usluga, teme za istraživanje, obrazovanje, promidžbene teme, pilot-istraživanja i slično. Tehničke uvjete za održavanja sastanka Vijeća korisnika osigurava CARNet. Troškove prisustvovanja sjednicama Vijeća korisnika snose ustanove članice.

Predsjedništvo Vijeća korisnika čine:

• Magdalena Babić OŠ Vrbani, Zagreb
• Prof. dr. sc. Dragutin Kermek, Fakultet organizacije i informatike, Varaždin
• Zlatka Markučič, dipl. ing., XV. Gimnazija, Zagreb
• Miroslav Mazurek, Strojarski fakultet, Slavonski Brod
• Damir Mrkonjić, ing., Institut za jadranske kulture i melioraciju krša, Split
• Lada Sartori, Fakultet elektrotehnike, strojarstva i brodogradnje, Split
• Mladen Vedriš, dipl. ing., Sveučilišni računski centar Srce, Zagreb

Funkciju privremenog predsjednika obnaša Damir Mrkonjić.

Do danas je održano devet sjednica Vijeća korisnika:

• Jedanaesta sjednica (održana 21.09.1011.)
• Deseta sjednica (održana 27.05.2009.)
• Deveta sjednica (održana 5.07.2007.)
• Osma sjednica (održana 30.6.2005.)
• Sedma sjednica (održana 30. lipnja 2003.)
• Šesta sjednica (održana 10. lipnja 2002.)
• Peta sjednica (održana 23. travnja 2001.)
• Četvrta sjednica (održana 2. lipnja 2000.)
• Treća sjednica (održana 24. studenog 1999.)
• Druga sjednica (održana 16. listopada 1998.)
• Prva sjednica (održana 12. prosinca 1996.).